Приказом №1503 от 26.12.2012 на основании решения Ученого совета Сибирского федерального университета от 24 декабря 2012 года Институт математики переименован в Институт математики и фундаментальной информатики (Institute of mathematics and Computer Science).

Новое название лучше отражает содержание образовательных программ, реализуемых в институте и соответствует направлениям научной деятельности сотрудников.